2023-2026. 科学研究費助成事業（基盤研究(B)）・日本学術振興会「海洋酸性化を生き抜く有孔虫の動態的な石灰化の解明」（研究分担者）

2020-2023. 科学研究費助成事業（基盤研究(B)）・日本学術振興会「生体分子に着目した“化石種にも使える”高精度有孔虫Mg/Ca水温計の開発」（研究分担者）

2019-2023. 科学研究費助成事業（基盤研究(B)）・日本学術振興会「ミトコンドリアDNAポリメラーゼの多様性と進化の全容解明」（研究分担者）

2018-2023. 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))・日本学術振興会「海洋原生生物に共生する細菌多様性の実態解明」（研究分担者）

2018-2020. 科学研究費助成事業（基盤研究(C)）・日本学術振興会「大規模分岐年代推定－真核生物の誕生と進化を解き明かす!!－」（研究代表者）

2017-2019. 科学研究費助成事業（基盤研究(B)）・日本学術振興会「有孔虫における殻形成機構の解明ー石灰化のブラックボックスを開くー」（研究分担者）

2016-2018. 科学研究費助成事業（基盤研究(C)）・日本学術振興会「原核藻類と原生動物の光共生に関する研究」（研究分担者）

2014-2016. 科学研究費助成事業（基盤研究(C)）・日本学術振興会「浮遊性有孔虫の新規環境指標の確立：遺伝子・安定同位体比・形態の複合解析から」（研究協力者）

2013-2015. 人材育成事業（海外特別研究員滞在費・研究活動費）・日本学術振興会「バイオミネラリゼーションと殻形態進化：化石の分子生物学への応用に向けて」（研究代表者）

2011-2013. 科学研究費助成事業（若手研究(B)）・日本学術振興会「浮遊性有孔虫の生物多様性と炭素循環の関係の解明」（研究協力者）

2010-2012. 人材育成事業（特別研究員奨励費）・日本学術振興会「環境変遷の基づく放散虫の進化と多様性，古海洋環境指標としての新展望」（研究代表者）