FORAMINIFERA
有孔虫
We have 3 clonally reproduced strains in the laboratory.
下記の無性世代培養株、３株を維持しています。
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Ammonia veneta (N in Toyofuku et al., 2004; T1/S4 in Bird et al., 2020)
Locality: 35.322608N, 139.634409E
Time: 2015/04/20
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Allogromia laticollaris
Locality: 22.650915N, 121.502151E
Time: 2019/05/16
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Bolivina variabilis (IIb in Kucera et al., 2017)
Locality: 35.141432N, 139.160972E
Time: 2022/03/23
Foraminifera have wide distribution, and its distribution is sensitive to the ambient environments (i.e., temperature, salinity, productivity...). Its taxonomy is traditionally based on morphological characters, but recent molecular study revealed that single morpho-species includes several genetic types. Biologically, it is quite important to unveil each ecological preference of genetic type for better understanding of marine protist's ecology. Paleontologically, its ecological preference at genetic type level potentially increase the accuracy of marine environment indicator.
有孔虫の分布域は非常に広く、その分布は周辺環境（水温・塩分・生産性など）に鋭敏に反応する。また、有孔虫の分類は伝統的に形態で行われてきたが、近年の分子生物学的研究の発展により１形態種に複数の遺伝子型が存在することがわかっている。つまり、遺伝子型毎の生息分布を精査することで、海洋原生生物の生態の理解に貢献することが期待される。また、遺伝子型毎の分布と環境要因の関係を精査することで、古海洋環境指標としての有用性が向上することが期待される。
Distribution of Pulleniatina obliquiloculata genetic types in the Indo-Pacific Warm Pool show the longitudinal clines. It suggest us that ocean currents have not impacted on the divergence of planktonic foraminifers.
インド洋ー太平洋暖水域におけるPulleniatina obliquiloculataの遺伝子型毎の分布をみると、経度方向の勾配がみられる。これは浮遊性有孔虫の分散に海流が効果的でないことを示唆している。
(Ujiié et al., 2012. [doi: 10.1002/ece3.286])
Recently, divergence time of species are estimated by molecular information, and this tool have a potential to estimate the evolutionary scenario of naked organisms. On the other hand, Foraminifera have good fossil record since the Cambrian. Their good fossil record can apply to check how the accuracy of molecular clock increase.
近年、生物の分岐時期を推定する分子時計が活用されており、化石記録を持たないような生物の進化シナリオを推定できるツールとして注目されている。一方で有孔虫は、カンブリア紀以降の保存の良い大量の化石記録を持っている。この有孔虫の信頼性の高い化石記録は分子時計の精度向上を行うための試金石として用いることができる。
Credible intervals (CIs) based on the four differenr gene datasets with four fossil calibration sets (A-D). Large gene dataset increase the preciseness of molecular clock. Also, Upper constraint (calibration set D) is greatly affected the estimation. (Ujiié and Ishitani, 2016.
４つの異なる化石制約と異なる遺伝子データセットにおける95%信頼区間の比較。遺伝子データセットが大きくなると分子時計の精度は向上し、下限制約が推定に大きく影響することがわかる。
Some foraminifers survive in polluted areas (i.e., heavy metal, micro-plastics), and recently they are used as pollution indicator. Besides, their large cell have another potential to figure out what happen on the cell during exposure in the pollutants.
有孔虫には汚染地域（重金属やマイクロプラスチック）でも生きる者がおり、汚染環境指標としても用いられている。一方で、単細胞である有孔虫の大きな細胞サイズは汚染物質が細胞にどのような影響を与えるかを観察するのに適しており、汚染物質の細胞への影響を評価する材料としても注目される。
Ammonia parkinsoniana treated with TiO2 nanoparticles shows high activity of Reactive Oxygen Species (green) and increase of neutral lipids (yellow).
TiO2微粒子に暴露したAmmonia parkinsonianaは活性酸素種（緑）中性脂肪（黄色）が多くなることがわかった。
(Ciacci et al., 2019. [doi:10.1038/s41598-019-56037-2])
